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毕业论文 琼脂糖凝胶上曙红DNA负染及其相关机制

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毕业论文-琼脂糖凝胶上曙红DNA负染及其相关机制,共49页,20443字,附任务书、开题报告、文献综述、开题报告等
课题的内容和任务要求
课题内容
研究DNA染料曙红负染检测技术(包括其机制,最佳实验条件,操作步骤,优化实验时间等);开发出一种安全便捷、成本低廉,真正能替代EB染色的DNA检测技术。
任务要求
琼脂糖凝胶电泳之后,对几块凝胶分别进行EY负染,锌咪唑负染,EB染色;之后用不同的观测方法对不同的染色凝胶进行图像分析,来比较不同染色方法的背景清晰度和对比度;然后对DNA进行提取回收,测回收率;再通过光谱分析对以上方法进行各方面比较;最后优化本实验方法。


摘要:本实验用EY设计了一种灵敏且简单的方法对DNA进行染色显像,该方法可在一张由EY染料沉淀所致的不透明的凝胶上形成一种稳定的水溶性DNA-染料复合物 。在这样的背景下,DNA以透明条带的形式被选择性地显像出来。与EB一样,用这个新的方法可使低至0.5-1ng量的DNA在1小时内显像出来。此外,我们也研究了染料结合机制,可归结为DNA和EY离子复合物是以沟槽形式结合。
关键词:DNA检测;负染;EY;琼脂糖凝胶


目 录
中文摘要…………………………………………………………………………………5
外文摘要…………………………………………………………………………………6
前言……………………………………………………………………………………7
1.材料……………………………………………………………………………………7
2.方法……………………………………………………………………………………7
2.1 凝胶电泳………………………………………………………………………7
2.2 DNA染色………………………………………………………………………8
2.2.1 EY负染……………………………………………………………………8
2.2.2 锌咪唑负染…………………………………………………………………8
2.2.3 EB染色……………………………………………………………………8
2.3图像分析…………………………………………………………………………8
2.4 DNA提取………………………………………………………………………8
2.5光谱检测…………………………………………………………………………9
2.5.1 紫外吸收光谱……………………………………………………………9
2.5.2 荧光光谱…………………………………………………………………9
3.结果与讨论……………………………………………………………………………9
3.1 优化染色条件………………………………………………………………9
3.2 EY染料与IZ,EB染料的对比………………………………………………10
3.3不同染色方法后DNA的提取回收……………………………………………12
3.4反应机制……………………………………………………………………12
4.结论 …………………………………………………………………………………14
5.参考文献………………………………………………………………………14
致谢…………………………………………………………………………………16


课题关键问题及难点
研究内容:
(1)探索建立DNA和染料相互作用的机制。
(2)充实和完善DNA负染检测机理,并筛选出对DNA具有选择性和亲和性的DNA染料。
(3)利用琼脂糖凝胶电泳技术,进一步优化染色条件,包括染料浓度、溶液极性和酸碱度、操作温度及染色时间等。
(4)对不同的DNA样品进行检测,进一步验证该技术的有效性和便捷性。
(5)同其他常用、经典的染色方法(如EB染色法)比较,以确定该方法的实用性。
(6)进行重复性实验,并测试染料的稳定性,建立质量技术标准。
技术关键
(1)探索DNA与染料结合的原理,筛选出更有效的染料化合物。
(2)对所用试剂进行探究和筛选,提高该染料与DNA的结合力。
三、完成该课题研究已具备的条件(有关的研究工作基础,仪器设备条件,经费情况)
工作条件
蛋白质组学实验室配有完整的基因组学研究设备,具备从事DNA检测研究所要求的染料筛选、合成、分离、染色等设备条件。
拥有超低温冰箱(-80℃以下)、超高速低温离心机(1×106g以上)、GE等电聚焦系统、DALT-SIX电泳仪、全自动切胶仪、透过式成像系统及分析软件、高速冷冻离心机、紫外分光光度计、红外分光光度计、600 MHz核磁共振仪、各种DNA分离纯化设备、流式细胞仪、二氧化碳培养箱、超声波提取器、多功能紫外透射反射分析仪、倒置显微镜、Elga超纯水系统、Bruka液质连用系统等先进设备、酶标仪、荧光仪。
四、研究方案
1. 拟采取的研究方法或试验方法及主要技术路线
(1)紫外/可见吸收光谱与荧光光谱判断染料和DNA的结合方式
(2)对染料库里的染料进一步筛选,挑选出几种和DNA具有高度亲和力的染料分子。
(3)采用聚丙烯凝胶电泳对λDNA/HaeIII标准品和Plasmid pMHP2分析。将等分梯度稀释的不同浓度的标准DNA溶液上样于含有8%聚丙烯酰胺的分离胶的样品槽中,以含有1 mM EDTA, 40 mM Tris-acetate, pH 8.0的缓冲溶液作为分离胶缓冲溶液,通电流(22 mA/胶),分离,即得。
(4)同时采用琼脂糖凝胶对λDNA/HaeIII进行分析。
(6)DNA染色:采用的染色法有本染色法、EB染色法与IZ染色法。
(7)图象分析:分析使用的凝胶图像通过显像系统(EpsonPerfection V700 Photo)和Molecular Imager Gel Doc XR System (BioRad)获得,产生的图像使用Science Lab 2006(FUJIFILM Corporation,Japan)分析软件分析处理。
(8)进行稳定性实验并确定质量技术标准


论文大小:3.53MB
论文格式:word
论文专业:药学
论文编号:207300
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